? В течение многих столетий две расы роботов-инопланетян — Автоботы и Десептиконы — вели войну, ставкой в которой была судьба Bселенной. И вот война докатилась до Земли. В то время, когда силы зла ищут ключ к верховной власти, наш последний шанс на спасение находится в руках юного землянина. Единственное, что стоит между несущими зло Десептиконами и высшей властью — это ключ, находящийся в руках простого парнишки.Обычный подросток, Сэм Уитвикки озабочен повседневными хлопотами — школа, друзья, машины, девочки. Не ведая о том, что он является последним шансом человечества на спасение, Сэм вместе со своей подругой Микаэлой оказываются вовлеченными в противостояние Автоботов и Десептиконов. Только тогда Сэм понимает истинное значение семейного девиза Уитвикки — «без жертв нет победы!»

? Битва за Землю закончилась, но битва за вселенную только началась. После возвращения на Кибертрон, Старскрим возглавляет Десептиконов и решает вернуться на Землю с подкреплением. Скорпонок похищает тело поверженного Мегатрона у армии США и возвращает его к жизни при помощи своей собственной Искры. Теперь главный Десептикон жаждет мести, а Старскрим со своим войском устремляется к Земле.

? (примерный сюжет) Оптимус Прай погиб. У автоботов, и у десептиконов появился новый враг. До тех пор малоизвестная раса Квинтессоны приготовилась к полному уничтожению Трансформеров. Позже Родомес Прайм узнал, что квинтессоны были создателями первых трансформеров, а Кибертрон был их фабрикой задолго до того, как он стал домом трансформеров. Квинтессоны настолько хотели уничтожить трансформеров что решили разрушить Кибертрон. Но всё же они были повержены уже взрослым Сэмом Уитвикки, так как теории исследования вероятности и общей логики квинтессонов, не смогли предугадать эмоциональные действия человека.Во вселенную была выпущена Чума Ненависти. Эта болезнь могла поразить и человека, и трансформера, угрожая уничтожить всё. В конечном итоге Родомес Прайм был заражён и Бравый (Скайлинкс), последний уцелевший из руководителей автоботов был вынужден отдать Матрицу квинтессонам. Квинтессоны смогли починить Оптимус Прайма, и тот с помощью Матрицы остановил чуму. Сила Матрицы после этого иссякла навсегда.
Оптимус Прайм вновь стал лидером автоботов и поклялся сдерживать десептиконов вечно.